87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01045 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_06121  putative Protein CrcB-like protein  100 
 
 
87 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01045  putative Protein CrcB-like protein  100 
 
 
87 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0985412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  51.95 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  51.28 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  52.5 
 
 
126 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  51.25 
 
 
150 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  46.25 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  46.99 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  47.5 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  40.79 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  48.75 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  40.79 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  40.79 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  40.51 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  43.66 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  43.21 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  50.82 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  50.82 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  50.82 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  41.89 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  41.89 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  41.89 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  41.89 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  41.89 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  41.89 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  41.89 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  41.89 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  50.82 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  47.54 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  36.62 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  41.77 
 
 
135 aa  57.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  41.89 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
126 aa  57  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  42.67 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  39.51 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  36.11 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  36.11 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  36 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  37.31 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  37.31 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  37.31 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0215  camphor resistance protein CrcB  52.31 
 
 
123 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.181294  hitchhiker  0.00640614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  37.31 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  37.31 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  45.28 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  38.75 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  56.76 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  42.86 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  40.98 
 
 
127 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  48.33 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  39.06 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  40.98 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0235  crcB protein  49.23 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.616495  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  43.9  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  43.9  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  31.94 
 
 
129 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  38.36 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  43.48 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  46.3 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  45.28 
 
 
124 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.4 
 
 
124 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  38.24 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0071  CrcB protein  50 
 
 
125 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3474  camphor resistance protein CrcB  43.04 
 
 
127 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  32.91 
 
 
129 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>