More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1338 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
121 aa  234  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  57.02 
 
 
147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  57.02 
 
 
147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32.79 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.17 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  37.21 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  37.21 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  36.43 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  36.43 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  36.43 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.21 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  34.43 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  42.86 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  42.39 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  42.27 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  34.15 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.33 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  34.88 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  42.39 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  31.03 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  39.13 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  45.16 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  37.39 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  35.25 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  32.23 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  42.05 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  33.62 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  44.57 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  45.26 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  38.78 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  30.77 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  44.57 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  33.64 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  43.16 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  45.12 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  42.53 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  29.41 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  36.97 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  33.33 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.29 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  38.04 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  42.53 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  38.95 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  30.97 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  42.86 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  42.86 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  41.58 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1099  crcB protein  38.3 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.236283  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  34.71 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  36.36 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  36 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  32.77 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  42.7 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  31.09 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  29.51 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  31.09 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>