More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0761 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  100 
 
 		 122 aa  230  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  90.16 
 
 		 122 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  88.79 
 
 		 107 aa  184  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  69.42 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  60.33 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  59.09 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  50.83 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  51.33 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  48.41 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  50.48 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  53.1 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  49.56 
 
 		 134 aa  93.6  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  54.21 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  49.55 
 
 		 113 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  46.9 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  48.62 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  47.66 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  44.72 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  47.46 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  44.79 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  44.79 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  44.79 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  44.79 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.36 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  45.53 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.36 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  43.27 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  41.24 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  43.09 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  47.66 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  47.42 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  43.27 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  40.2 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  40.19 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  76.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  46.9 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  47.41 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  41.6 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  39.32 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.8 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  46.23 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  46.53 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  38.52 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  39.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  40.87 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.5 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  40.62 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  38.3 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  44.86 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  37.19 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  57.45 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  48.04 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  47.92 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  38.14 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  37.61 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  43.1 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  39.58 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  39.58 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  37.61 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  34.43 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  40 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  36.19 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  53.01 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  43.4 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  38.1 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  40.2 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  39.58 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  41.28 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  40.17 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  44.12 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  44.76 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  38.54 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  34.55 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1434  camphor resistance protein CrcB  48.42 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  42.45 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  41.28 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>