More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5305 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 113 aa  215  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  65.18 
 
 		 125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  52.38 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  53.06 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  47.32 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  53.1 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  49.55 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  49.09 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  52.04 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  50.45 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  49.02 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  48.18 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  47.27 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  47.79 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  50.47 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  45.87 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  46.94 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  48.98 
 
 		 128 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  50 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  48.35 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  48.35 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  41.18 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  47.42 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.75 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  40.54 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  41.82 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  49.47 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  44.44 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.62 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  43.14 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  46.99 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  46 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  35.87 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  42.68 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  38.74 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  39.6 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.64 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32.35 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  43.88 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  42.11 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  40.66 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  39.08 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  41.11 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  39.08 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  39.18 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  43.37 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  41.11 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  44.05 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  34.34 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  39.58 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.04 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  48.15 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.04 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  39.51 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  44.32 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  39.76 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0372  CrcB protein  39.8 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  34.78 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  34.94 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  40.22 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  39.8 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  39.8 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.8 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  37.25 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  39.51 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  37.76 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  40.62 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1434  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.23 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  40.82 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>