More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3620 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  233  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  88.71 
 
 		 124 aa  213  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  76.23 
 
 		 128 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  70.16 
 
 		 124 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  59.35 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  53.66 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  59.5 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  56.2 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  55 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  49.59 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  57.94 
 
 		 127 aa  113  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  48.7 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  48.33 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  54.92 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  49.17 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  45.83 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  50.41 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  63.86 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  49.52 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  43.1 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  49.18 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  48.11 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  53.77 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  42.86 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  48.98 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  53.12 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  46.23 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  48.65 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  47.87 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  41.13 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  41.07 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  39.82 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  39.66 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  37.61 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  35.65 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  41.51 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  39.47 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  34.71 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  34.71 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  38.05 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  36.97 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  38.33 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  43.62 
 
 		 228 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  43.27 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  43.48 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  39.39 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  39.66 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  37.5 
 
 		 131 aa  67  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  37.29 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  36.19 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  37.84 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.96 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.36 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.36 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  35 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  42.86 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  36.36 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  40 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  31.5 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1339  CrcB family protein  40 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0192605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1306  CrcB protein  37.74 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  34.55 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  38.98 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  38.39 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1468  CrcB protein  37.74 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  40.68 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  36.15 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  35.59 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  38.78 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  38.79 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>