More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1665 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 128 aa  248  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  57.02 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  54.1 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  56.56 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  51.24 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 124 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 124 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  52.07 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  52.07 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  56.56 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  54.92 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  53.91 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  53.28 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  57.26 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  48.18 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  53.28 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  49.14 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  49.24 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  46.97 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  44.54 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  47.93 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  43.4 
 
 		 228 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  42.98 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  48.25 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  41.03 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  39.5 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  39.17 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  47.32 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  38.66 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  38.98 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  37.5 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  42.61 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  41.74 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.54 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  43.88 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  34.96 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  40.38 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.5 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  34.71 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  39.5 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  39.5 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  41.38 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  34.78 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  40.87 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  40.22 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  41.8 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  39.66 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  41.41 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  36.11 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  43.56 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  39.83 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  37.93 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  36.84 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  36.21 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  39.34 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  37.5 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  35.54 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>