More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4673 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  100 
 
 
128 aa  239  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  46.28 
 
 
125 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  43.65 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  43.31 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  44.96 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  43.8 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  44.96 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  44.72 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  39.5 
 
 
193 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  40.94 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.34 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  45.28 
 
 
124 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  45 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  44.96 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1434  camphor resistance protein CrcB  49.09 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  35.14 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  44.34 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  50.59 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  36.59 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  45.1 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  43.97 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  51.32 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  40 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  43.31 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  40.16 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  40.31 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  32 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  39.64 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  46.23 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36.13 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  40.19 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  43.97 
 
 
122 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  47.15 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  36.97 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  35.16 
 
 
127 aa  67  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 
123 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  31.19 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  36.43 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  49.37 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  33.6 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  42.42 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0461  Camphor resistance CrcB protein  47.52 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.32096 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  44.09 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  41.86 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  37.27 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  36.92 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  37.01 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  44.88 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.27 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  34.38 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  38.74 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  35.66 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  37.27 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  37.27 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  43.55 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  32 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  44.66 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  32.28 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  37.61 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  35.11 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  38.78 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  35.19 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  34.68 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  35.19 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  41.94 
 
 
228 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  43.06 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  36.36 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  45.54 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  31.75 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  35.2 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  39.13 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  34 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  37.84 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  31.78 
 
 
132 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>