More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0461 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0461  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
124 aa  237  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.32096 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  52.42 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  58.33 
 
 
124 aa  127  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  55.65 
 
 
124 aa  123  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  46.34 
 
 
125 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  40.32 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40.83 
 
 
124 aa  84.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  46.67 
 
 
128 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36.61 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  37.07 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  37.07 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  41.51 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  36.67 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.61 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  43.33 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  45.19 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  45.19 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  37.61 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  38.39 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  35.77 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  37.29 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  38.14 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  35.04 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  42.02 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  36.89 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  35.48 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  40.82 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1434  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  39.17 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  44.21 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.33 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  37.1 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40.37 
 
 
133 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  33.61 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  44.14 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  39.5 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  41.88 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  34.96 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  31.3 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  41.23 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  36.89 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  40.59 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  32.23 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  36.73 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  45.61 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  41.03 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  36.04 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>