More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2102 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
124 aa  236  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  58.06 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  54.03 
 
 
124 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  53.66 
 
 
125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  49.19 
 
 
126 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0461  Camphor resistance CrcB protein  60.82 
 
 
124 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.32096 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.34 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  45.63 
 
 
124 aa  84.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40.68 
 
 
124 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  43.52 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 
123 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  44.35 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36.29 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  38.94 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  42.4 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  42.11 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  42.11 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.35 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  44.76 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  43.64 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  38.52 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  38.74 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  39.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  35.48 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  37.5 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  34.43 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  37.4 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1434  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  37.1 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  37.96 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  34.17 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  38.46 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  30.65 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  40.21 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  41.82 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  40 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0908  CrcB protein  46.15 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.862739  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  34.15 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>