More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0397 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  100 
 
 		 166 aa  313  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  45.3 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  44.25 
 
 		 126 aa  84  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  48.08 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  49.09 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  44.26 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  41.23 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  46.43 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  37.8 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  47.75 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  36.36 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.7 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  38.79 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.18 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  33.8 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  36.07 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  29.55 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  32.31 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  32.56 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  31.78 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  42.45 
 
 		 126 aa  67  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 		 128 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  41.3 
 
 		 133 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  32.56 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  42.55 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  30.94 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  31.01 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  37.59 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  31.78 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  42.37 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  40.16 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.4 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  35.96 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  31.82 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  31.71 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  31.01 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  31.01 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  39.66 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  31.01 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  46.36 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  47.96 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  36.13 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  36.59 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  43.14 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  38.39 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7365  Camphor resistance CrcB protein  40.45 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  35.83 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1098  camphor resistance CrcB protein  38.26 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.25603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  38.28 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  33.04 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  37.29 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  28.91 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  35.66 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  36.52 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  38.58 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  40.66 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  42.7 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  30.88 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  37.61 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  37.07 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  37.21 
 
 		 128 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  39.77 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  33.91 
 
 		 123 aa  57  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>