172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1284 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1284  integral membrane protein for chromosome condensation  100 
 
 
129 aa  255  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000191693  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  39.34 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  41.23 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0953  camphor resistance protein CrcB  48.28 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  36.52 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  33.59 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  43.18 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  33.33 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  34.75 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  36.36 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  39 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  34.96 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  34.88 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
124 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  38.95 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  28.24 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  31.2 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  34.38 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  35.63 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  41.1 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  41.1 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  36.07 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  35.05 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  29.71 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  30.95 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  31.19 
 
 
124 aa  52  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  30.08 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  37.18 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  38.46 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  30.77 
 
 
132 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  34.02 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  26.83 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  30.4 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 
118 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0845  Integral membrane protein for chromosome condensation  26.52 
 
 
178 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  31.58 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  34.78 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  31.52 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  30.09 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  32.5 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  33.98 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  30.43 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  37.65 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  33.03 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  30.43 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  31.58 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  34.58 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  33.33 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  34.41 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  35.58 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  31.54 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  32.14 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  32.14 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  33.68 
 
 
154 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  31.58 
 
 
127 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  29.37 
 
 
128 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  32.58 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  33.33 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  32.41 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  32.63 
 
 
179 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  39.08 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07660  CrcB-like protein  54.17 
 
 
161 aa  45.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107392  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  32.95 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  31.33 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  28.41 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  35.23 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0242  Camphor resistance CrcB protein  34.15 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  32.08 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5115  Camphor resistance CrcB protein  34.62 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>