28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3405 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3405  CrcB protein  100 
 
 		 66 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  80.7 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  80.7 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  80.7 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  75.44 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  75.44 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  63.89 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  71.19 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  58.18 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  43.4 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  48.08 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  45.28 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  45 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  43.1 
 
 		 126 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  47.17 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  50.94 
 
 		 129 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  43.4 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  50.94 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  48.21 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  47.17 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  44.23 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  40.74 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  52.5 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  40 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>