More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2955 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
117 aa  224  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  65.74 
 
 
124 aa  133  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  58.97 
 
 
123 aa  126  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  55.14 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2322  camphor resistance protein CrcB  58.59 
 
 
129 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  53.54 
 
 
120 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.19 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.19 
 
 
126 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  64.37 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  41.44 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  43.88 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3967  CrcB protein  49.48 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.336072 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  37.39 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  41.84 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.53 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  51.02 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  38.53 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  41.84 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  43.52 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  44.95 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  40.18 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  46.85 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5013  CrcB protein  50.93 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.37 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  40.37 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  42.2 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  39.64 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  38.46 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  39.45 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  40.21 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  47.42 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.53 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  39.62 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  38.74 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  39.18 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  40.54 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  30.97 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  42.45 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  32.17 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  39.62 
 
 
122 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  33.96 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  37.5 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  42.45 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  38.68 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 
124 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  34.48 
 
 
123 aa  66.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  36.45 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3282  Camphor resistance CrcB protein  41.35 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  32.76 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  40.83 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  35.83 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  36.04 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  34.26 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  38.6 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  37.27 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  33.04 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  31.53 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  36.61 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  36.04 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  31.58 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  38.94 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  30.17 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  33.94 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  37.89 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  32.41 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  37.65 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  30.97 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  38.1 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  35.9 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  41.32 
 
 
131 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  40.96 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  34.82 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  39.47 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>