More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2322 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2322  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 129 aa  245  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  65.89 
 
 		 124 aa  161  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  57.36 
 
 		 123 aa  127  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  60.61 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  52.07 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  49.19 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  60.82 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  46.79 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  43.2 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  45.97 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  50.52 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  30.4 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  30.4 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  34.65 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.98 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3967  CrcB protein  47 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.336072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  42.06 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  40.48 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  35.38 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  37.8 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  38.58 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  45.36 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  29.69 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  42.55 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.02 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.29 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  36.07 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  37.21 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  38.21 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  38.39 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  39.81 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  35.48 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  38.28 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  36.64 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  40.37 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  40.37 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  40.37 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  36.72 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  32.31 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  39.81 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  32 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  44.21 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0372  CrcB protein  48.35 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.15 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  38.89 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  41.53 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  39 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  36.63 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0071  CrcB protein  57.14 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  38.54 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0455  Camphor resistance CrcB protein  39.47 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.592746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  38.33 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3029  camphor resistance protein CrcB  43.44 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  31.2 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  34.65 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  35.25 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  39.58 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  32.28 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  35.88 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  32.43 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  29.23 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  34.88 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  32.03 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  34.78 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  32.76 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  31.19 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  36.92 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>