More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0071 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0071  CrcB protein  100 
 
 		 125 aa  228  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  60.42 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  53 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  53.93 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  51.11 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  40.45 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  40.45 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  50.59 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  43.96 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  55.91 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  42.55 
 
 		 124 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2322  camphor resistance protein CrcB  55.96 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  48 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.88 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  42.15 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  44.58 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  43.37 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  37.08 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  39.56 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  36.54 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.64 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  38.26 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  41.51 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  36.96 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  41.24 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  37.96 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  40.45 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  40.91 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  40.66 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  38.04 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  34.71 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.54 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.64 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  42 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  42.53 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  39.32 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  38.64 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  39.77 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  38.64 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  42.16 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.43 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.18 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  35.24 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  42.73 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  37.72 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  36.84 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  39.83 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  39.18 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  44.07 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  40.86 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3967  CrcB protein  39.39 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.336072 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  36.89 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  35.71 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  34.38 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  38.4 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  35.63 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>