More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1310 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  100 
 
 		 114 aa  214  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 124 aa  95.9  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  49.14 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  41.03 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  40.17 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  45.83 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  51.65 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  47.46 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  42.73 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  42.31 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  52.38 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2322  camphor resistance protein CrcB  48.45 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  56.18 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5013  CrcB protein  51.3 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  39.45 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.04 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0372  CrcB protein  50.6 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  45.69 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  39.42 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  35.04 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  40.17 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  41.96 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  45 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  40 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  36.45 
 
 		 123 aa  66.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  45.63 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  37.61 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  42.48 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  38.33 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  43.97 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  42.34 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  37.39 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  45.71 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  37.5 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  43.14 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  39.5 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.67 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  37.93 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  41.82 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.93 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1480  CrcB protein  38.94 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  44.21 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  34.51 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  37.39 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  33.64 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.08 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  33.91 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  38.2 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  37.08 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  38.2 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>