More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0202 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 132 aa  254  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  80.15 
 
 		 133 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  52.8 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  52 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  45.16 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  47.11 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  49.12 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  43.7 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  50.45 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  45.3 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  40.71 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  41.35 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  41.35 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  41.53 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  40 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  43.24 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  47.47 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  44.66 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.31 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  41.74 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  39.02 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  36.36 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  36.67 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  36.27 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  38.28 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  39.69 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  41.59 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  48.72 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  37.63 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  39.52 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  44.12 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  41.51 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  32.71 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  33.88 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  40.87 
 
 		 270 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  38.94 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  39.8 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  32.17 
 
 		 126 aa  66.6  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  35.58 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  42.61 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  37.93 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.47 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  41.82 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  33.63 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  37.82 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  30.58 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  35.83 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  33.6 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  38.76 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  37.27 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  43.01 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  41.11 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  39.39 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  40.34 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  38.71 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  39.17 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  42.74 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>