More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2948 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  71.97 
 
 		 142 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  58.41 
 
 		 116 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  54.69 
 
 		 136 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  58.33 
 
 		 114 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  55.14 
 
 		 114 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  52.29 
 
 		 119 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  52.29 
 
 		 119 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  49.61 
 
 		 132 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  50 
 
 		 114 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  51.4 
 
 		 110 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  45.67 
 
 		 131 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  51.4 
 
 		 110 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  49.54 
 
 		 138 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  47.2 
 
 		 129 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  50.91 
 
 		 118 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  46.72 
 
 		 137 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  46.72 
 
 		 144 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  46.46 
 
 		 143 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  42.59 
 
 		 112 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 		 128 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  46.53 
 
 		 113 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  46.73 
 
 		 110 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  38.89 
 
 		 126 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  45.87 
 
 		 116 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  42.52 
 
 		 138 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  46.08 
 
 		 125 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  46.08 
 
 		 125 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  46.3 
 
 		 116 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  43.43 
 
 		 112 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  42.86 
 
 		 119 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  40.98 
 
 		 142 aa  92  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  40.95 
 
 		 114 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  44.55 
 
 		 130 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  43.43 
 
 		 114 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  42.31 
 
 		 115 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  39.45 
 
 		 112 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  42.99 
 
 		 114 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  48.08 
 
 		 134 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 		 126 aa  88.6  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  45.37 
 
 		 114 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  42.16 
 
 		 426 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  42.72 
 
 		 115 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  41.8 
 
 		 140 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  43.8 
 
 		 121 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  41.12 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  37 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40.16 
 
 		 124 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  35.64 
 
 		 102 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  35.64 
 
 		 102 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  44.88 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  42.16 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 133 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  40.22 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 131 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  42.37 
 
 		 131 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  39.25 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0201  camphor resistance CrcB protein  37.93 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  38.32 
 
 		 115 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2508  hypothetical protein  42.11 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.93047e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  31.86 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  38.71 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  34.92 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  39.84 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  37.76 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1527  Camphor resistance CrcB protein  40 
 
 		 147 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  39.17 
 
 		 125 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  37.17 
 
 		 115 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 131 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  39.22 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 123 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  36.27 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  34 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  43.88 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  36.63 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  38.21 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  42.06 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  35.29 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  38.54 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  40.2 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 134 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  36.27 
 
 		 112 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  36.17 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  34.13 
 
 		 127 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  37.5 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 128 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2298  hypothetical protein  41.9 
 
 		 113 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  38.33 
 
 		 126 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  38.83 
 
 		 124 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>