292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2708 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  224  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  48.72 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  43.8 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  43.48 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  41.8 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  39.66 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  39.66 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  39.29 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  36.52 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  40.95 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  41.88 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2322  camphor resistance protein CrcB  50.49 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  46.51 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  40.52 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  37.25 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  38.98 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  38.78 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  38.79 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  39.36 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  32.5 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.29 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  39.36 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  35.29 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  31.67 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  37.29 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  37.86 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  36.19 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32.11 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  38.95 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  33.93 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  31.75 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1305  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  31.03 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  31.03 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0372  CrcB protein  41.05 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  31.03 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1467  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  42.48 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  33.9 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  33.33 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  45.83 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  33.33 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  32 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  34.78 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  30.65 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  36.04 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  36 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  36.97 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  38.33 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0455  Camphor resistance CrcB protein  41.67 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.592746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  32.5 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  37.61 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  37.5 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  30.58 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5116  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  30.65 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  34.78 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  36.27 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  36.96 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  39.18 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  27.35 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>