228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3963 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  43.33 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  39.47 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  32.5 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.33 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.33 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  34.17 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  44.09 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  33.61 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  37.29 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  35.96 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  30.83 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.91 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  35.59 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  38.39 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  34.78 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  38.1 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  45.1 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1098  camphor resistance CrcB protein  31.86 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.25603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  40.48 
 
 		 127 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  31.3 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  44.71 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  37.93 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  37.07 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  34.96 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  39.13 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5763  Camphor resistance CrcB protein  43.9 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  33.04 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  31.82 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  31.48 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  44.58 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  41.46 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  31.67 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  30.43 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  31.93 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  32.48 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  35.63 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 		 118 aa  50.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0845  Integral membrane protein for chromosome condensation  37.17 
 
 		 178 aa  50.8  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  36.59 
 
 		 122 aa  50.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  39.74 
 
 		 169 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  29.41 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  31.67 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  37.8 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  36.14 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  33.94 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  40.22 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  30.43 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3030  camphor resistance protein CrcB  38.55 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  31.19 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  35.8 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  32.94 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.76 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17591  hypothetical protein  31.86 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.212024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  38.38 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  32.17 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  32.53 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 		 128 aa  47.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  40.24 
 
 		 121 aa  47.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  33.33 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  38.27 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  31.19 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>