61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0845 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0845  Integral membrane protein for chromosome condensation  100 
 
 
178 aa  354  3.9999999999999996e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  32.41 
 
 
162 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0116  CrcB-like protein  38.98 
 
 
139 aa  59.7  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  36.09 
 
 
159 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1345  Integral membrane protein for chromosome condensation  45.56 
 
 
410 aa  54.7  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  32.8 
 
 
122 aa  52.4  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  31.58 
 
 
131 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  37.17 
 
 
115 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  30.56 
 
 
127 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0124  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 
132 aa  48.9  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1284  integral membrane protein for chromosome condensation  26.52 
 
 
129 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000191693  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  30.51 
 
 
121 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  40.78 
 
 
130 aa  48.5  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  31.36 
 
 
133 aa  47.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  32 
 
 
121 aa  48.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  31.39 
 
 
142 aa  48.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  30.77 
 
 
124 aa  47.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
147 aa  47.8  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
147 aa  47.8  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  28.68 
 
 
127 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  25.81 
 
 
134 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  25.81 
 
 
134 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  25.81 
 
 
134 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  29.69 
 
 
127 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5763  Camphor resistance CrcB protein  32.74 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  32.69 
 
 
127 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  30.7 
 
 
133 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  29.29 
 
 
127 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  25.23 
 
 
126 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  31.54 
 
 
128 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  34.31 
 
 
129 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  25.23 
 
 
126 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  32.14 
 
 
152 aa  44.7  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0089  camphor resistance protein CrcB  33 
 
 
126 aa  44.7  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  28.46 
 
 
128 aa  44.7  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  29.08 
 
 
134 aa  44.3  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  26.98 
 
 
125 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  34.15 
 
 
116 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  29.29 
 
 
127 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  29.29 
 
 
127 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  28.85 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  32.35 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  33.09 
 
 
127 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  32.06 
 
 
121 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  29.91 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
129 aa  42  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  31.39 
 
 
143 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  37.14 
 
 
144 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  29.63 
 
 
133 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  27.52 
 
 
127 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  27.52 
 
 
127 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  27.52 
 
 
127 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  27.52 
 
 
127 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  27.52 
 
 
127 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  32.97 
 
 
125 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  30.48 
 
 
122 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  28.28 
 
 
131 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  32.52 
 
 
118 aa  41.2  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  30.47 
 
 
270 aa  41.2  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 
122 aa  40.8  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  30.97 
 
 
124 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>