27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0116 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0116  CrcB-like protein  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0845  Integral membrane protein for chromosome condensation  41.41 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  37.5 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  32.99 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  32.99 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  32.63 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  43.1 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  31.25 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25360  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation  48.08 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0836479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  38.33 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.57 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  36.67 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  37.18 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  35.23 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  33.7 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  31.58 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  28.85 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  34.92 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  34.92 
 
 		 127 aa  40  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01591  hypothetical protein  43.4 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 127 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>