154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25360 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_25360  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation  100 
 
 
136 aa  253  7e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0836479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  35.25 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  42 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  32.81 
 
 
126 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  32.28 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  33.94 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  36.29 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  33.06 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  34.38 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  33.08 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  34.11 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  34.11 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  33.07 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  33.07 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  33.07 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  27.13 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  38.17 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  30.16 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  27.91 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  32.81 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  29.37 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  29.6 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  29.37 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  29.37 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  29.92 
 
 
118 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  32.54 
 
 
129 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  31.53 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  31.53 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  31.53 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  31.53 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  31.53 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  32.03 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  29.37 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  32.82 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5115  Camphor resistance CrcB protein  33.04 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0845  Integral membrane protein for chromosome condensation  34.11 
 
 
178 aa  50.4  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  30.71 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  35.71 
 
 
124 aa  50.1  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1468  CrcB protein  30.51 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  30.23 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  31 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1306  CrcB protein  30.51 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0089  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  32.99 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  35.42 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  29.84 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  35.23 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  29.73 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  30.95 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  33.87 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  31.2 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  29.73 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  29.73 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5116  camphor resistance protein CrcB  33.6 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  29.73 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  33.07 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0117  putative CrcB protein  34.29 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  32.8 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  29.73 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  30.33 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  29.73 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  26.92 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  29.73 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  29.73 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  29.73 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  27.78 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  29.73 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  27.91 
 
 
118 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  36.67 
 
 
166 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  35.94 
 
 
127 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  38.89 
 
 
120 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0930  camphor resistance CrcB protein  32.52 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.942183  hitchhiker  0.00352151 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0116  CrcB-like protein  48.08 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  30.93 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  33.07 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  29.6 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0135  hypothetical protein  36.89 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  32 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  28 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  27.59 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  31.03 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  32.03 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  25.4 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  32.28 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  31.67 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  27.2 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  35.66 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  33.33 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  25.45 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  32.5 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  32.79 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>