121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0117 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0117  putative CrcB protein  100 
 
 		 136 aa  266  5.9999999999999995e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  35.9 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1836  camphor resistance CrcB protein  34.23 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1871  camphor resistance CrcB protein  34.23 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  39.08 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1344  Integral membrane protein for chromosome condensation  33.06 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  31.48 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  30.65 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  33.68 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  33.68 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  30.93 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  31.52 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  31.25 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  30.93 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  33 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1339  CrcB family protein  35.14 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0192605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  32.32 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  32 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  32 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  28.83 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  34.88 
 
 		 127 aa  48.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  36.67 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  31.82 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  36.78 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  36.78 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.12 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  31.07 
 
 		 120 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  29.09 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1480  CrcB protein  28.07 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  36.78 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  33.88 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  36.9 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  34.26 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  27.83 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  31.18 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  27.03 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  28.04 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  30.48 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  37.5 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  33.78 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  30.48 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  33.06 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  27.83 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  29.2 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  32.35 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  32.98 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  37.63 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  31.3 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  26.89 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  32.35 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  32.35 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  31.4 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  35.05 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  30.59 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  30.23 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  32.35 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  28.43 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  29.07 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  39.68 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  31.9 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  39.68 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  35.23 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  32.35 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  32.35 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  32.35 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  34.74 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  32.35 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  32.35 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  34.12 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  28.41 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  38.81 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  28.41 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3282  Camphor resistance CrcB protein  27.72 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  28.41 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  29.41 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  36.78 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  39.39 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32.14 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  33.68 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  28.91 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  25.96 
 
 		 128 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 128 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  29.67 
 
 		 124 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  25.86 
 
 		 121 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  35.35 
 
 		 118 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  31.4 
 
 		 122 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  29.81 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0089  camphor resistance protein CrcB  32.43 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  30.23 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  24.58 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  35.11 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  39.44 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25360  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation  35.44 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0836479  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  32.61 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  43.08 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  37.89 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  33.72 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>