145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1344 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1344  Integral membrane protein for chromosome condensation  100 
 
 
131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  40.34 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  32.26 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  33.33 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0117  putative CrcB protein  34.92 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1480  CrcB protein  31.45 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  30.33 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  30.4 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  32.17 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  35.35 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  31.62 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  33.66 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  32.04 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 
126 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  32.67 
 
 
137 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  32.67 
 
 
137 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  32.08 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  28.57 
 
 
124 aa  51.2  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  32.67 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  35.05 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  33.66 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  35.37 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  30.19 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  31.62 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  31.25 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  31.09 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  32.67 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  29.57 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  30.19 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  30.19 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  34.02 
 
 
126 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  33.02 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  32.67 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  32.65 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  32.31 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  30.84 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  31.53 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  31.78 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  34.02 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  31.11 
 
 
134 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  31.11 
 
 
134 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  31.63 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  30.51 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  34.65 
 
 
125 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  35.05 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  29.31 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  31.78 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  31.63 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  33.01 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  31.63 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  31.63 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  31.63 
 
 
127 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  31.63 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  31.63 
 
 
127 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  31.63 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  29.27 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  31.86 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  28.45 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  32.29 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  31.67 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  27.97 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  28 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  35.51 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  36.9 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  31.48 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  27.83 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01591  hypothetical protein  32.18 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  31.46 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 
124 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  32.97 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  28.04 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  32.35 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  28.95 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  27.2 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  29.59 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1725  CRCB protein-like  26.32 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.617604  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  25 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  28.57 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1836  camphor resistance CrcB protein  28.46 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1871  camphor resistance CrcB protein  28.46 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  25.64 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  28.12 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5115  Camphor resistance CrcB protein  28.33 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  29.35 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  30.56 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  30.56 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  27.88 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  28.57 
 
 
127 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  28.57 
 
 
127 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  28.57 
 
 
127 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  28.46 
 
 
124 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  28.57 
 
 
127 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  28.57 
 
 
127 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  27.56 
 
 
118 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>