More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2957 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
170 aa  330  6e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  54.72 
 
 
173 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  51.28 
 
 
126 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  55.56 
 
 
155 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  47.06 
 
 
208 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  45.39 
 
 
169 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  48.57 
 
 
167 aa  90.9  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  47.54 
 
 
166 aa  88.2  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  43.8 
 
 
127 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  51.59 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  44.09 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  37.82 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  33.12 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3030  camphor resistance protein CrcB  43.36 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  35.29 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  37.19 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40.87 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
125 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
123 aa  67  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  42.42 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  35.58 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  44.19 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  38.89 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  35.77 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  32.48 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  27.2 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  35.77 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  35.83 
 
 
123 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  36.43 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  27.94 
 
 
134 aa  63.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  36.75 
 
 
130 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  38.46 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  37.29 
 
 
142 aa  62.4  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  35.94 
 
 
138 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
140 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  34.38 
 
 
193 aa  62  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
140 aa  62  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  37.88 
 
 
133 aa  61.6  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  36.21 
 
 
121 aa  61.6  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  45.92 
 
 
121 aa  61.2  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  33.07 
 
 
131 aa  61.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  35.09 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  42.27 
 
 
133 aa  60.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
127 aa  60.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  35.42 
 
 
126 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  41.84 
 
 
126 aa  60.8  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  33.33 
 
 
123 aa  60.8  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  34.23 
 
 
122 aa  60.8  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0931  camphor resistance CrcB protein  37.17 
 
 
124 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.683731  hitchhiker  0.00174486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
124 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7365  Camphor resistance CrcB protein  42.86 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  35.42 
 
 
126 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  36.67 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  37.21 
 
 
99 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  37.5 
 
 
126 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 
124 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  40.66 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 
124 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  35.14 
 
 
125 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  35.14 
 
 
125 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 
124 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  37.07 
 
 
131 aa  59.7  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 
132 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  36.67 
 
 
122 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  39.77 
 
 
107 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  38.14 
 
 
136 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 
127 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  31.68 
 
 
124 aa  58.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  38.04 
 
 
125 aa  58.2  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  34.13 
 
 
124 aa  58.2  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  38.53 
 
 
122 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  35.71 
 
 
114 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 
113 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  39.77 
 
 
122 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  33.93 
 
 
128 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  39.53 
 
 
117 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  37.98 
 
 
124 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>