44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1725 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1725  CRCB protein-like  100 
 
 
122 aa  230  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.617604  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18421  hypothetical protein  70.59 
 
 
123 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.293589  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18211  hypothetical protein  60.98 
 
 
83 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1836  camphor resistance CrcB protein  33.62 
 
 
117 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1871  camphor resistance CrcB protein  33.62 
 
 
117 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01591  hypothetical protein  32.26 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  27.97 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  27.52 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  30.71 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  26.09 
 
 
124 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0089  camphor resistance protein CrcB  29.73 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  26.5 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  27.19 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  31.78 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17591  hypothetical protein  38.38 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.212024  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  27.72 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  34.74 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  26.83 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  34.31 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1344  Integral membrane protein for chromosome condensation  26.83 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  31.46 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1480  CrcB protein  35.29 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0117  putative CrcB protein  31.4 
 
 
136 aa  43.5  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  25.78 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  28.44 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5013  CrcB protein  23.01 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  42.86 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  27.83 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  28.35 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  36.17 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  28.46 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  35.71 
 
 
122 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  26.79 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  34.15 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  26.79 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1339  CrcB family protein  31.93 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0192605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  27.38 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  25.62 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  28.89 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  26.97 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  28.89 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  38.33 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0135  hypothetical protein  35.48 
 
 
126 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>