175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0135 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0135  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  243  6e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0089  camphor resistance protein CrcB  76.8 
 
 
126 aa  192  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01591  hypothetical protein  65.29 
 
 
135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17591  hypothetical protein  39.67 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.212024  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32.48 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1211  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0908  CrcB protein  43.75 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.862739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  37.61 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  30.48 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  29.75 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  37.08 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  32.22 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  39.02 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20861  hypothetical protein  37.5 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  32.74 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 
124 aa  50.4  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  36.78 
 
 
130 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  32.17 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  36.26 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  35.56 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  31.11 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  39.77 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  34.75 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  30.63 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  35.71 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  30.77 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  32.63 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  26.4 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  35.56 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  28.81 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  39.02 
 
 
124 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  36.96 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  34.09 
 
 
126 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
126 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  41.1 
 
 
129 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  29.84 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  31.09 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  28.23 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  32.67 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  38.55 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  35.63 
 
 
123 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  31.01 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.35 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  37.35 
 
 
131 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  38.37 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.14 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  32.14 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  37.65 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  34.51 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01601  hypothetical protein  35.9 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 
270 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  44.26 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  42.47 
 
 
254 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  30.17 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  34.31 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2562  Camphor resistance CrcB protein  36.36 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  31.71 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  36.05 
 
 
208 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  30.51 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  33.33 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  31.46 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  28.07 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  30.33 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  34.12 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  34.94 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  29.75 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  27.27 
 
 
128 aa  44.3  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>