236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2562 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2562  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 		 126 aa  238  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0373  Camphor resistance CrcB protein  54.92 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0519  Camphor resistance CrcB protein  53.66 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2183  Camphor resistance CrcB protein  48 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0494  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  48.54 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0931  camphor resistance CrcB protein  36.28 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.683731  hitchhiker  0.00174486 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  43.18 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1098  camphor resistance CrcB protein  34.91 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.25603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  40.87 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  32.23 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0339  Camphor resistance CrcB protein  46.51 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  34.86 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  43.02 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  43.33 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  41.51 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.08 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  41.05 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  37.08 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  38.14 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  42.05 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  38.61 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  37.17 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  40.66 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  32.54 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  40.7 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  33.07 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  35.87 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  40 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  33.96 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  36.78 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  39.08 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  35.29 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  34.44 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  35.35 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  29.66 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  37.21 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  37.62 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  34.83 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  41.11 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  42.47 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  42.17 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  37.19 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  40.24 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  34.45 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  40.66 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  34.86 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  37.08 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  37.78 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0930  camphor resistance CrcB protein  35.63 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.942183  hitchhiker  0.00352151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  36.05 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  36.84 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  34.45 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  38.71 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  41.94 
 
 		 228 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  40.24 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 124 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  33.07 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 124 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  35.92 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>