35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0373 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0373  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
137 aa  256  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2183  Camphor resistance CrcB protein  63.97 
 
 
139 aa  147  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2562  Camphor resistance CrcB protein  54.92 
 
 
126 aa  110  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0519  Camphor resistance CrcB protein  50.86 
 
 
128 aa  93.6  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0494  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0931  camphor resistance CrcB protein  38.53 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.683731  hitchhiker  0.00174486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1098  camphor resistance CrcB protein  37.27 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.25603  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
122 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0339  Camphor resistance CrcB protein  48 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  34.78 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  35.58 
 
 
122 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  30.08 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  34.62 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  39.22 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  32.81 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  43.9 
 
 
129 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  35.79 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  35.63 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01601  hypothetical protein  35.71 
 
 
117 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  39.51 
 
 
140 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  39.08 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  32.58 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  32.93 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  35.42 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  32.08 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  33.73 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  30.33 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  36.14 
 
 
122 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0953  camphor resistance protein CrcB  34.38 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  34.38 
 
 
131 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>