More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4410 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  62.79 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  66.09 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1727  camphor resistance protein CrcB  66.41 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1774  camphor resistance protein CrcB  66.41 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0528824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1706  camphor resistance protein CrcB  66.41 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5763  Camphor resistance CrcB protein  57.55 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13086  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.588628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  36.43 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  35.77 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.87 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.87 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  41.23 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  36.84 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  46.67 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  47.56 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  38.18 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  39.13 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  34.21 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  35.29 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  38.78 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  41.23 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  38.39 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  36.89 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1305  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1467  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  38.53 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  37.5 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  33.93 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  33.93 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  30.56 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  35.71 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  34.13 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5014  Camphor resistance CrcB protein  43.48 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  36.94 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  31.19 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5116  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  35.45 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  42.31 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  32.17 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  31.36 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  38.18 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  34.55 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  33.64 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  31.58 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  31.82 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  40.37 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  31.9 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  40 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  27.84 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  33.66 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  31.13 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  41.11 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  30.17 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  32.04 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  29.73 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  36.7 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  31.07 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  32.73 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  31.71 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  32.71 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  28.45 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  33.87 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  29.27 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  31.68 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  30.17 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  31.3 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  30.51 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  31.3 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  37.37 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  29.9 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  31.68 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  36.27 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  32.62 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  25.49 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  23.28 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  32.26 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  32.94 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  31.13 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>