258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3965 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
179 aa  352  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7365  Camphor resistance CrcB protein  63.74 
 
 
97 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  40.88 
 
 
208 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  40.71 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  42.52 
 
 
166 aa  84.3  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  43.27 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  52.11 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  43.22 
 
 
123 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  41.82 
 
 
131 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.83 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  36.61 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  37.27 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  43.86 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  32.03 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  37.19 
 
 
124 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  37.93 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  35 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  34.17 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  36.11 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
132 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  40.66 
 
 
126 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
126 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 
135 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  41.46 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  36.72 
 
 
133 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.91 
 
 
121 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  45.24 
 
 
144 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  34.65 
 
 
129 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 
128 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
129 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
124 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  38.4 
 
 
131 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  34.92 
 
 
127 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  33.33 
 
 
122 aa  59.3  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  39.64 
 
 
124 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
134 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
124 aa  58.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  30.58 
 
 
130 aa  58.2  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  35.19 
 
 
126 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  36.75 
 
 
151 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  33.88 
 
 
124 aa  58.2  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  45.35 
 
 
120 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  40.86 
 
 
228 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  39.37 
 
 
132 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  33.09 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  33.61 
 
 
131 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  40 
 
 
122 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  32.87 
 
 
193 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  35.35 
 
 
146 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 
128 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  37.19 
 
 
128 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  35.51 
 
 
124 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  34.58 
 
 
124 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  33.6 
 
 
124 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  31.86 
 
 
126 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  32.14 
 
 
118 aa  55.5  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 
124 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  34.82 
 
 
143 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  38.14 
 
 
124 aa  54.7  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  45.88 
 
 
120 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 
125 aa  54.3  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  41.3 
 
 
124 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  35.04 
 
 
124 aa  54.3  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  32.12 
 
 
140 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  36.52 
 
 
123 aa  54.3  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 
129 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  33.6 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  32.32 
 
 
130 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1727  camphor resistance protein CrcB  39.39 
 
 
132 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1774  camphor resistance protein CrcB  39.39 
 
 
132 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0528824  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1706  camphor resistance protein CrcB  39.39 
 
 
132 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  30.48 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  37.29 
 
 
127 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  38.05 
 
 
118 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 
128 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  31.3 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
130 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  28.28 
 
 
99 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  36.75 
 
 
127 aa  52.4  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
124 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  35.25 
 
 
134 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
124 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  33.88 
 
 
132 aa  52.4  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>