170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_A24 on replicon NC_008496
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
133 aa  261  3e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0124  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  35.45 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  30.56 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  31.71 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  31.58 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  29.17 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  35.24 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  28.69 
 
 
131 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  29.17 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  35.64 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  31.25 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  31.25 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  37.39 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  33.9 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  33.05 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  30.43 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32.8 
 
 
134 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  27.07 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  33.94 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  32.5 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  32.74 
 
 
166 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  33.04 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  33.75 
 
 
169 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 
131 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  32.56 
 
 
173 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  44.58 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  44.58 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  44.58 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  29.6 
 
 
270 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  32.22 
 
 
193 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  44.58 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  35.25 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  32.79 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  44.58 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  34.45 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5763  Camphor resistance CrcB protein  40 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  30.94 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  42.17 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  33.33 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  28.81 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1305  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  43.37 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1467  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  33.33 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1339  CrcB family protein  28.93 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0192605  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  43.37 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  32.43 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  43.37 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  37.21 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  39.13 
 
 
127 aa  47.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  32.91 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  41.56 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  32.76 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  35.71 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  31.67 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  30.71 
 
 
131 aa  47.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  33.33 
 
 
133 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  32.69 
 
 
114 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  33.33 
 
 
122 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
129 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2659  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
139 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.298553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
118 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  33.33 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  32.5 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  32.93 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  36.97 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  34.65 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  29.6 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0845  Integral membrane protein for chromosome condensation  30.7 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  32.5 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  31.67 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  32.5 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  39.76 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  30 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  32.08 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  40.96 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  32.74 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  29.55 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  28.05 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  34.62 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  30.21 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  30.43 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  32.43 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.35 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  35.71 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>