More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5014 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5014  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 		 125 aa  223  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  50 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  52.1 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  50 
 
 		 166 aa  90.1  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  57.89 
 
 		 167 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  49.46 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  48.62 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  36.36 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  42.11 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  44.23 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.13 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  48.94 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  42.61 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  38.4 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  39.68 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.1 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  41.75 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  39.34 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  40.98 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.69 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  36.44 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.02 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  41.38 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  44.25 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  45.79 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  27.83 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  43.14 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  43.14 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  32.26 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  49.48 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  42.37 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  42.99 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  44.79 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  42.16 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  47 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  27.5 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  43.48 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.36 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  39.6 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  35.34 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1706  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  39.83 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1727  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1774  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0528824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.86 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  40.37 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  32.76 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  42.55 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  46.15 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  32.76 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  37.93 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  31.9 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  35.24 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  49.51 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  37.9 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  36.96 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>