More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2515 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  81.07 
 
 
169 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  54.35 
 
 
208 aa  131  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  56 
 
 
155 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  52.85 
 
 
126 aa  111  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 
173 aa  101  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  46.4 
 
 
170 aa  99  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  42.66 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  40 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  39.32 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  39.17 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3030  camphor resistance protein CrcB  51.16 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  31.85 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.74 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  43.59 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.92 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  32.8 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
137 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  32 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  34.53 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  35.4 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  42.27 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  38.14 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  34.19 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  40.19 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  37.78 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  37.37 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  33.63 
 
 
124 aa  63.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  45.88 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  34.15 
 
 
132 aa  63.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  35.86 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  42.39 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  36.22 
 
 
138 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  37.4 
 
 
142 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
137 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  37.11 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  29.37 
 
 
144 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
137 aa  61.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
137 aa  61.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  40.21 
 
 
122 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  34.75 
 
 
128 aa  61.2  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 
144 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
99 aa  60.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5763  Camphor resistance CrcB protein  42.45 
 
 
140 aa  60.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  33.09 
 
 
135 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5014  Camphor resistance CrcB protein  49.45 
 
 
125 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  32.74 
 
 
130 aa  60.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  36.7 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
125 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 
124 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
118 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 
129 aa  58.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  34.01 
 
 
193 aa  58.2  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  36.04 
 
 
122 aa  58.5  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 
124 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  32.11 
 
 
130 aa  58.2  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  32.11 
 
 
118 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  37.23 
 
 
123 aa  57.8  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  32.11 
 
 
118 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  30.09 
 
 
128 aa  57.8  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  34.45 
 
 
127 aa  57.4  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 
124 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
129 aa  57.4  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1706  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 
132 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  32.11 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  34.23 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  32.11 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1727  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 
132 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1774  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 
132 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0528824  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  39.52 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  41.27 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>