More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0191 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
159 aa  291  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  40.26 
 
 
162 aa  97.4  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  45.24 
 
 
143 aa  87  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3281  Camphor resistance CrcB protein  56.25 
 
 
152 aa  84.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  46.03 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  43.7 
 
 
115 aa  79  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  40.62 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  43.12 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  38.28 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.7 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  34.65 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  31.15 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.4 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  40.68 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  51.06 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  43.18 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  46.83 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  43.18 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  32.48 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  43.18 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  47.79 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  47.31 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  34.43 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  38.4 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  37.16 
 
 
208 aa  67.4  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  30.36 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.13 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  42.5 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  33.86 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  34.15 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  39.74 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  41.13 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  42.86 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  41.13 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  42.98 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  39.55 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  29.46 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  37.59 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  41.32 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  30.58 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  40.48 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  38.33 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  37.7 
 
 
127 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
124 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 
124 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  37.72 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  36.89 
 
 
122 aa  61.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
118 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  38.4 
 
 
122 aa  60.8  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  37.23 
 
 
127 aa  60.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  36.89 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0494  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  41.82 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  40.83 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  38.1 
 
 
270 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
129 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>