More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2061 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
133 aa  258  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  42.86 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  42.48 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  40 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  29.27 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  29.27 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  29.27 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.14 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  41.41 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  30.97 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  37.27 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  30.97 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 
144 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.13 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  36.94 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  37.61 
 
 
123 aa  67  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  28.12 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  45.56 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  37.14 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  36.13 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  44.19 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  45.78 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  39.22 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  41.74 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  37.5 
 
 
169 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  31.06 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 
122 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  35.09 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  28.68 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 
270 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  41.27 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  36.03 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  36.73 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  45.12 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  35.96 
 
 
208 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  36.46 
 
 
130 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  38.6 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  57.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  36.46 
 
 
130 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  41.76 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  41.76 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  35 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  37.1 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  41.23 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3030  camphor resistance protein CrcB  53.45 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  33.64 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  38.24 
 
 
179 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  39.05 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  30.43 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  35.09 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  32.2 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  35.65 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  34.65 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  33.87 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  35.94 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  35.92 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  37.39 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  36.27 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  37.19 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>