229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3144 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
155 aa  296  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  54.29 
 
 
208 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  56.08 
 
 
173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  57.94 
 
 
126 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  56.31 
 
 
170 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  56.36 
 
 
167 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  54.01 
 
 
169 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  46.4 
 
 
127 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  54.55 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  45.19 
 
 
166 aa  87.8  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3030  camphor resistance protein CrcB  52.38 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  39.09 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  39.52 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  41.82 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  33.85 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 
125 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  47.06 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.57 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  37.84 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  33.6 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  35.04 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  34.51 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  34.96 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  40.8 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  33.61 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5763  Camphor resistance CrcB protein  47 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  33.61 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  39.13 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  38.68 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  40.91 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
127 aa  58.9  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7365  Camphor resistance CrcB protein  37.89 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.29 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 
132 aa  57.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  41 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  35.48 
 
 
115 aa  57.4  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  30 
 
 
126 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  36.44 
 
 
126 aa  57.4  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  32.56 
 
 
132 aa  57.4  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  30 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  34.23 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  36.11 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  31.08 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
124 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  44.12 
 
 
121 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0931  camphor resistance CrcB protein  35.71 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.683731  hitchhiker  0.00174486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  27.92 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5014  Camphor resistance CrcB protein  48.53 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17591  hypothetical protein  28.21 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.212024  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  35.4 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  40.59 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  32.17 
 
 
127 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  33.6 
 
 
129 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  34.83 
 
 
126 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  39.8 
 
 
154 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  40.59 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  33.61 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  32.43 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1098  camphor resistance CrcB protein  33.86 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.25603  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  34.48 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  31.93 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  43.59 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  35.71 
 
 
193 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  30 
 
 
124 aa  50.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  37.25 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24000  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation  44.05 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517865  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  33.71 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  36.96 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2659  camphor resistance protein CrcB  38.64 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.298553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  38.38 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  38.66 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  40 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  33.71 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  33.59 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  35.23 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  28.87 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  34.26 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  26.36 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  42.53 
 
 
136 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  37.27 
 
 
124 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>