138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1440 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  100 
 
 		 208 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  56.8 
 
 		 155 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  52.94 
 
 		 169 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  56.36 
 
 		 167 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  52.85 
 
 		 126 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  47.9 
 
 		 173 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  48.74 
 
 		 170 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  43.31 
 
 		 127 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  43.08 
 
 		 166 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  45.39 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3030  camphor resistance protein CrcB  49.31 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  38.66 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  30.52 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.78 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 126 aa  62  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7365  Camphor resistance CrcB protein  42.22 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5763  Camphor resistance CrcB protein  43.3 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  43.04 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 131 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 		 131 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.67 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  36.07 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  31.43 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  41.77 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  34.35 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  34.03 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  31.67 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  41.18 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 		 132 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  33.33 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  37.4 
 
 		 136 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  34 
 
 		 123 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0931  camphor resistance CrcB protein  38.04 
 
 		 124 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.683731  hitchhiker  0.00174486 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  32.84 
 
 		 125 aa  52.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 		 125 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  36.97 
 
 		 124 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  29.84 
 
 		 128 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  28.57 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  30.43 
 
 		 137 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  29.85 
 
 		 137 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  39.08 
 
 		 144 aa  52  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 		 124 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  39.08 
 
 		 124 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  28.57 
 
 		 134 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  28.89 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  29.17 
 
 		 130 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  29.85 
 
 		 137 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 		 129 aa  50.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  29.85 
 
 		 137 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  33.01 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  38.55 
 
 		 129 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  37.86 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17591  hypothetical protein  29.81 
 
 		 130 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.212024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  28.36 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 		 124 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  32 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  41.57 
 
 		 120 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  32.76 
 
 		 132 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 120 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 		 124 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  31.3 
 
 		 143 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 		 124 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  38.78 
 
 		 130 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  28.06 
 
 		 137 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  33.05 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  37.63 
 
 		 128 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  36.63 
 
 		 124 aa  48.5  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25370  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation  36.78 
 
 		 168 aa  48.5  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0605599  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  34.13 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 124 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 129 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  33.93 
 
 		 126 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  35.04 
 
 		 121 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  35.64 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  33.93 
 
 		 115 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  24.19 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  36.54 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  26.43 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1098  camphor resistance CrcB protein  30.95 
 
 		 140 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.25603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5014  Camphor resistance CrcB protein  43.48 
 
 		 125 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 125 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  28.57 
 
 		 120 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  32.04 
 
 		 128 aa  45.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  33.67 
 
 		 118 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  35.63 
 
 		 162 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  35.71 
 
 		 131 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0135  hypothetical protein  35.63 
 
 		 126 aa  45.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  36.75 
 
 		 117 aa  45.1  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  32.65 
 
 		 118 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  33.33 
 
 		 124 aa  45.1  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24000  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation  37.27 
 
 		 129 aa  45.1  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517865  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  31.01 
 
 		 128 aa  45.1  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2659  camphor resistance protein CrcB  34.09 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.298553  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  31.58 
 
 		 142 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  32.48 
 
 		 122 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 		 124 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  36.25 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>