23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1211 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1211  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
124 aa  232  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20861  hypothetical protein  91.13 
 
 
124 aa  194  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0089  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17591  hypothetical protein  39.02 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.212024  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01591  hypothetical protein  34.48 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0135  hypothetical protein  36.36 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01601  hypothetical protein  29.84 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  28.23 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 
133 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  33.06 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0015  camphor resistance CrcB protein  35.96 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  30.77 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  35.56 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  32.14 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  39.33 
 
 
125 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  25.83 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  30.08 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  34.4 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5013  CrcB protein  29.06 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  27.42 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  37.63 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  28.07 
 
 
125 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>