More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1481 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1481  camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
132 aa  251  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  39.2 
 
 
134 aa  90.1  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  45.08 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  43.22 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  40.62 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  39.53 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  39.1 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 
134 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  36 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  40.86 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  41.11 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  40.66 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  37.14 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  32.11 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  40.54 
 
 
117 aa  67  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  37.72 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  34.17 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  32.5 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  34.35 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  33.33 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  36.44 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  36.96 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  35.04 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  36.72 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  32 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  36.19 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  35.51 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.38 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.84 
 
 
122 aa  60.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  35.34 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  33.87 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  41.3 
 
 
132 aa  59.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  34.58 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5115  Camphor resistance CrcB protein  31.82 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  32.28 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  36.44 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  40.7 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  38.37 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  32.5 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  35.14 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3967  CrcB protein  41.3 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.336072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  31.15 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  46.91 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  31.86 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  33.93 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  34.55 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  33.65 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0455  Camphor resistance CrcB protein  35.51 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.592746  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  38.89 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  29.92 
 
 
270 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
137 aa  57  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  33.64 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.35 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.35 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0525  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000215561  normal  0.935924 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  43.18 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  31.86 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  45.68 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>