More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1574 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 358 aa  713    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  53.74 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  37.82 
 
 		 353 aa  183  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1063  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  31.18 
 
 		 390 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4537  glycosyltransferase-like  33.08 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3826  glycosyltransferase-like protein  33.08 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2479  hypothetical protein  29.14 
 
 		 379 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2617  hypothetical protein  29.14 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0912  putative glycosyltransferase group 1 protein  29.14 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3698  glycosyltransferase-like protein  33.08 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 368 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  29.48 
 
 		 378 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0549  hypothetical protein  29.75 
 
 		 379 aa  89.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2240  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like  29.41 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00876086  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3729  glycosyltransferase-like protein  31.54 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5552  glycosyltransferase-like protein  31.54 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4913  glycosyltransferase-like protein  31.7 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.937309  hitchhiker  0.000826652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1961  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  27.21 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3543  putative glycosyl transferase  28.95 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  26.38 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  27.68 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  42.4 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  43.68 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  37.61 
 
 		 426 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  46.74 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  51.72 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  43.2 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 410 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  37.89 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  47.06 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  41.05 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  46.43 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  48.57 
 
 		 803 aa  66.6  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  44.83 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  45.88 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  45.65 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  39.58 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  35.09 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  45.05 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.4 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  41.25 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  37.72 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  42.16 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  37.61 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  38 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  24.36 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  43.02 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  44.32 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6402  glycosyl transferase group 1  41.27 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 		 439 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 		 439 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 		 399 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  42.98 
 
 		 386 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  42.31 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.8 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  40.35 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  44.14 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  40.86 
 
 		 598 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  41.41 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  40.38 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  44.59 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4642  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.1 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  40.74 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  45.28 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>