92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3543 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3543  putative glycosyl transferase  100 
 
 
382 aa  749    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  41.71 
 
 
393 aa  262  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  39.18 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1063  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  37.77 
 
 
390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.699119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5552  glycosyltransferase-like protein  39.89 
 
 
378 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823545  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3729  glycosyltransferase-like protein  39.89 
 
 
378 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3826  glycosyltransferase-like protein  39.62 
 
 
381 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4537  glycosyltransferase-like  39.62 
 
 
381 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3698  glycosyltransferase-like protein  39.34 
 
 
381 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4913  glycosyltransferase-like protein  39.66 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.937309  hitchhiker  0.000826652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2240  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like  37.7 
 
 
396 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00876086  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1961  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  35.85 
 
 
392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0912  putative glycosyltransferase group 1 protein  38.52 
 
 
379 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2479  hypothetical protein  38.52 
 
 
379 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2617  hypothetical protein  38.25 
 
 
379 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675029  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0549  hypothetical protein  38.29 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  31.01 
 
 
364 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
358 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
370 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  38.21 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0549  hypothetical protein  26.73 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  38.21 
 
 
368 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0054  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.025543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2468  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
386 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.822544  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
816 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4248  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
356 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
426 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
381 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
871 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
419 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1957  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
351 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.181444  normal  0.44965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3003  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
762 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
431 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2006  group 1 glycosyl transferase  47.62 
 
 
411 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.669637  normal  0.233825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  43.16 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
349 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3020  glycosyl transferase group 1  52.94 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
373 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  40.37 
 
 
433 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
375 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
363 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  22.05 
 
 
366 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
303 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  27.69 
 
 
822 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  39.74 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5607  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  43.04 
 
 
370 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
373 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
517 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  35.34 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.73 
 
 
411 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
377 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
375 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
426 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
350 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
383 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
371 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
439 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
392 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
440 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5888  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
389 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
750 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
406 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5440  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
372 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
414 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
666 aa  43.1  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 
367 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
774 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
739 aa  42.7  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
373 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
426 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>