65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0912 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0912  putative glycosyltransferase group 1 protein  100 
 
 
379 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2479  hypothetical protein  99.74 
 
 
379 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2617  hypothetical protein  99.74 
 
 
379 aa  760    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675029  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0549  hypothetical protein  92.88 
 
 
379 aa  628  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  74.8 
 
 
378 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5552  glycosyltransferase-like protein  76.39 
 
 
378 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823545  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3729  glycosyltransferase-like protein  76.13 
 
 
378 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3698  glycosyltransferase-like protein  74.2 
 
 
381 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3826  glycosyltransferase-like protein  73.94 
 
 
381 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4537  glycosyltransferase-like  73.94 
 
 
381 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4913  glycosyltransferase-like protein  77.3 
 
 
379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.937309  hitchhiker  0.000826652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1961  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  69.19 
 
 
392 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2240  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like  70.03 
 
 
396 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00876086  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1063  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  66.67 
 
 
390 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.699119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  42.18 
 
 
393 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3543  putative glycosyl transferase  38.42 
 
 
382 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  35.06 
 
 
364 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
358 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 
384 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  38.79 
 
 
380 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
373 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 
368 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  38.83 
 
 
368 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
339 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  40.91 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
422 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0054  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.025543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 
376 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3568  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 
232 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0564  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
380 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0549  hypothetical protein  29.14 
 
 
336 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1957  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
351 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.181444  normal  0.44965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  36.23 
 
 
353 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
394 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  39.77 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
341 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  36.15 
 
 
366 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 
385 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  41.28 
 
 
425 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  35.24 
 
 
419 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
366 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
413 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 
379 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  32.22 
 
 
423 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  41.58 
 
 
372 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
431 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  38.14 
 
 
377 aa  43.5  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
422 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 
370 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1456  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
371 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
440 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>