More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6402 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6402  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
517 aa  1018    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  72.54 
 
 
447 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  57.18 
 
 
411 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  54.66 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
446 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  27.79 
 
 
738 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
753 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
425 aa  88.2  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 
417 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
435 aa  87.4  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.45 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
414 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
800 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  41.58 
 
 
379 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  30.32 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  35.43 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  30.79 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  23.92 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  37.43 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  22.27 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.34 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.82 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  22.74 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
382 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
768 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  40 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  37.72 
 
 
482 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  33.03 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
396 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
413 aa  72  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  36.48 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  32.72 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  27.49 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.78 
 
 
389 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  29.17 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  36.68 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  25.18 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  43.97 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
768 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  31.36 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.12 
 
 
935 aa  68.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  28.42 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  39.07 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.48 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  26.85 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>