More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0751 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
384 aa  739    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  53.45 
 
 
358 aa  302  7.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  41.9 
 
 
353 aa  196  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  38.39 
 
 
370 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
393 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
368 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3543  putative glycosyl transferase  34.7 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1063  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  31.46 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.699119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  39.83 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4537  glycosyltransferase-like  32 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3826  glycosyltransferase-like protein  32 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5552  glycosyltransferase-like protein  32.03 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823545  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3729  glycosyltransferase-like protein  32.03 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3698  glycosyltransferase-like protein  32 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  29.29 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  39.88 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4913  glycosyltransferase-like protein  37.23 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.937309  hitchhiker  0.000826652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  27.21 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  43.9 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  43.3 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1961  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  33.99 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2240  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like  35.56 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00876086  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  29.3 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  46.07 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  37.38 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
371 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  46.43 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0912  putative glycosyltransferase group 1 protein  35.83 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2479  hypothetical protein  35.83 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2617  hypothetical protein  35.83 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  42.05 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
419 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  41.05 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  33.61 
 
 
388 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  39.39 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  35.57 
 
 
467 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  44.21 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.08 
 
 
407 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
379 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  60.66 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  32.72 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  44 
 
 
386 aa  63.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 
375 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
404 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
390 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0549  hypothetical protein  33.08 
 
 
379 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  44.58 
 
 
392 aa  63.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  42.17 
 
 
398 aa  63.2  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 
426 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
387 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  45.65 
 
 
388 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  29.08 
 
 
426 aa  63.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  31.65 
 
 
385 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  47.5 
 
 
433 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  38.05 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  40.57 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  39.81 
 
 
406 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  46.07 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2358  Glycosyltransferase-like protein  29.95 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12906  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  39.51 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
425 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  42.39 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
458 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 
420 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 
420 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  45.83 
 
 
376 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  39.32 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
384 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  41.86 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 
356 aa  60.1  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
419 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 
411 aa  59.7  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
415 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
373 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  41.86 
 
 
387 aa  59.7  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
417 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  50.85 
 
 
424 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>