More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3343 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 368 aa  730    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  96.2 
 
 		 368 aa  656    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2358  Glycosyltransferase-like protein  32.93 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0997  hypothetical protein  32.47 
 
 		 272 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3543  putative glycosyl transferase  33.17 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  41.67 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 		 428 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1063  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  33.54 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  24.36 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2240  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like  47.14 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00876086  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  30.34 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.57 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1961  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  45.71 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4913  glycosyltransferase-like protein  38.78 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.937309  hitchhiker  0.000826652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  28.11 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  39.81 
 
 		 423 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3729  glycosyltransferase-like protein  36.63 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5552  glycosyltransferase-like protein  36.63 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  36.63 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  43.06 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  25.1 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  42.65 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  53.45 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 		 422 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 		 748 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  41.57 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 		 366 aa  57  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 387 aa  57  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2810  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.2 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4537  glycosyltransferase-like  35.64 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3826  glycosyltransferase-like protein  35.64 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3698  glycosyltransferase-like protein  35.64 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  38.53 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  25.71 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  38.53 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 402 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3347  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 400 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  29.82 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 402 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  45.07 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  41.86 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 385 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 500 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 		 398 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>