193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2358 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2358  Glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
355 aa  730    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
370 aa  96.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
353 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0997  hypothetical protein  31.07 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3089  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0549  hypothetical protein  27.06 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  34.72 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
374 aa  63.5  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3568  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
232 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
384 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 
425 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
426 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  27.41 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
346 aa  56.6  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  44.78 
 
 
410 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0054  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.025543  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  36.21 
 
 
401 aa  56.6  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
414 aa  56.2  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  20.31 
 
 
391 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0336  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
399 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  43.75 
 
 
462 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1805  hypothetical protein  22.48 
 
 
338 aa  53.1  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  44.78 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
368 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
374 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
400 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
358 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
422 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  25.98 
 
 
381 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  41.98 
 
 
430 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
355 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  25.12 
 
 
370 aa  49.3  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
419 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
446 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
422 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
440 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1701  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
363 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0309421  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
411 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
440 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  38.75 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 
418 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  42.03 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5607  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
428 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
407 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1456  glycosyl transferase group 1  37.88 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 
419 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  25.98 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
370 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
426 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
403 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3146  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 
382 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  29.19 
 
 
413 aa  47  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
413 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
348 aa  46.6  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  34.21 
 
 
343 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  32.08 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
344 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
423 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  27.55 
 
 
364 aa  46.2  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
412 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
359 aa  46.2  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
428 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  40.3 
 
 
424 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  27.96 
 
 
778 aa  45.8  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  27.51 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  41.54 
 
 
434 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0185  glycosyl transferase, group 1  40.62 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.634207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
422 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>