138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0997 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0997  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0549  hypothetical protein  37.31 
 
 
336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 
353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2358  Glycosyltransferase-like protein  31.07 
 
 
355 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3089  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  30.96 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 
371 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
404 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
381 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  41.46 
 
 
400 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0054  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.025543  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
373 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
419 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
368 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  39.68 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
380 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  41.89 
 
 
401 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
382 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
368 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 
424 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 
374 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  38.2 
 
 
377 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.2 
 
 
380 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4023  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
352 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
372 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  48.39 
 
 
412 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2859  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
354 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  48.39 
 
 
412 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  45.16 
 
 
412 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  40.3 
 
 
370 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
353 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
410 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1961  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  30.41 
 
 
392 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
358 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
383 aa  48.9  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.62 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
371 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 
364 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  38.04 
 
 
408 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  29.11 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
371 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2240  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like  30.41 
 
 
396 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00876086  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
388 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
410 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  32.5 
 
 
382 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1805  hypothetical protein  23.11 
 
 
338 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
378 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
396 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
378 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
379 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  31.15 
 
 
346 aa  46.6  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
378 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  42.31 
 
 
452 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  25.19 
 
 
364 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
437 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
384 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
437 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  42.67 
 
 
387 aa  45.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
378 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
387 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1373  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
447 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.87 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 
414 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  40.98 
 
 
417 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  39.68 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
426 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  43.4 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3568  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
378 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 
376 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
822 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
403 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
396 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  32 
 
 
403 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
387 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.44 
 
 
388 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1063  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  32 
 
 
390 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.699119 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  38.57 
 
 
374 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 
419 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
387 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0292  glycosyl transferase, group 1  39.39 
 
 
349 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0527106  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  54.35 
 
 
409 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  28.48 
 
 
340 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1374  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
615 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0108808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4022  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
386 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
384 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  37.88 
 
 
407 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
389 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
393 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  39.06 
 
 
381 aa  43.5  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2841  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
420 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>