16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0549 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0549  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  680    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0997  hypothetical protein  37.17 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2358  Glycosyltransferase-like protein  27.24 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3543  putative glycosyl transferase  26.73 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  22.27 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 		 435 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0054  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.025543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  25.49 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 374 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 370 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.937397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>